中医认为，其病性早期属热证、实证，为湿热、毒火阻滞肝脉；后期则伴有肝肾不足。治疗主要是根据症状、体征，结合舌脉，一般将本病分为三型，即湿热下注、毒热蕴结、肾气不足，分别给予不同的治疗方法：
①属于湿热下注证的生殖器疱疹，常见生殖器部位水疱成簇，周边有红晕，或有糜烂，有轻痒，可见小便黄赤，口苦，口渴，舌红苔黄腻，脉弦滑。这是由于素日喜肥甘厚味，辛辣之品，或嗜烟酒，损伤脾胃，脾失健运，水湿内蕴，郁而化热，湿热之邪下注肝经所致。湿热蕴积于下焦，注于阴部，发为生殖器疱疹。治疗法则宜清热除湿，方药常以龙胆泻肝汤加减：龙胆草10克，山栀克，黄芩克，柴胡克，车前子(包)克，生地克，当归克，木通克，生甘草克。方中龙胆草清泻肝经湿热；山栀、黄芩、柴胡配合龙胆草清肝利胆；车前子、木通清热利湿；生地、当归凉血活血；生甘草调和诸药。水疱大、糜烂渗液者，加生苡仁30克，茵陈克；大便秘结者，加生大黄6克(后下)。现有中成药龙胆泻肝丸,每次6--8克,每日3次,温开水送服。
②属于毒热蕴结证的生殖器疱疹，见阴部疱疹大而红，局部肿胀，疼痛明显，腹股沟淋巴结肿大，或有低热，排尿困难，舌红绛，脉滑数。这是由于不洁性交，外染淫毒，毒热结聚阴部，蕴结于局部皮肤粘膜所致。治疗法则宜清热解毒，常以方药为清毒神圣汤加减：金银花、天花粉、蒲公英、板蓝根各30克，当归15克，生甘草10克。方中金银花清热解毒为主药；天花粉排毒驱腐；蒲公英、板蓝根配合主药加强治疗作用；当归、生甘草养血活血，调和诸药。如小便黄赤，排尿疼痛困难者，加马鞭草15克，天葵子、淡竹叶各10克；淋巴结肿大疼痛者，加地丁30克，夏枯草10克。
③属于肾气不足证的生殖器疱疹，常见于复发性阴部疱疹，疱疹干涸较小，无自觉症状，但经常复发。这是由于肾气不足，淫毒之邪未尽所致。肾开窍于前后二阴，或由于房劳过度，或由于湿热、淫毒久稽，耗伤肾阴；日久阴损及阳，也可造成肾阳不足。肾阴肾阳是人体最宝贵的物质，统帅着人体全身的阴阳，当肾阴肾阳受损后，人体阴阳就会失调，疾病就容易复发。由于肾气不足故多伴有腰膝酸软，浑身乏力。阴虚者，则多有五心烦热，失眠多梦，遗精早泄，舌红少苔，脉象细数。肾阳不足者，则多有手足不温，少腹拘急，舌淡苔薄，脉象沉细。治疗法则以补肾为主，佐以解毒除湿。常用方药为六味地黄丸加减：茯苓、山药各15克，山萸肉、枸杞子、泽泻、丹皮、板蓝根、生、熟地各10克。
方中生熟地滋补肾阴；山药、山萸肉、枸杞子滋补肝脾肾三阴；茯苓、泽泻、丹皮乃补中有泻；板蓝根清泻余毒。如阴虚火旺者，加女贞子、知母各10克；肾阳不足者，加制附片、肉桂、仙灵脾各10克。
阴虚内热，表现：殖器疱疹，反复发作，日久不愈，渗液较少。伴咽干唇燥，五心烦热。舌红绛，苔花剥，脉细数。可用中成药：①知柏地黄丸，每次9克，每日2次，空腹时温开水送服。②大补阴丸，每次9克，每日2--3次，淡盐汤或温开水送服。
4.事实证明，常用的一些中药外洗方或外治方，可以减轻生殖器疱疹的疼痛和症状，内治和外治结合起来可提高疗效。
以下介绍几则中药外洗方和外治方：
①取马齿苋30克，野菊花30克，黄柏30克，煎汤约200毫升外洗，每日2次，每次洗敷15分钟。
②用木贼草、板蓝根各30克，煎汤约200毫升外洗，每日2次，每次30分钟。
③取芒硝100克，兑入沸水300毫升，待凉后外洗患部。
④用鲜半边莲适量，洗净后捣如泥，敷于患处，盖上纱布，每日换药1--2次。
5.家庭自疗：
①取半枝莲适量，捣烂敷于患处，每日2次。
②用马齿苋适量，捣成茸状，外敷患处，每日换药1次。
③取新鲜无花果叶数片，洗净捣烂,加食醋适量，调匀成稀泥状，敷于患处，干则更换。
④用生大黄、黄连、黄柏各30克，乳香、没药各15克。共研为细末，用时以麻油调成糊状，涂于疮面上，每日1次。
5）专家建议：对于生殖器疱疹的患者，必要的忌口是防止复发的必要条件。如常吃辛辣发物，抽烟饮酒都对康复不利，特别是饮酒可促使本病复发，加重本病的症状，所以，患病后一定不要饮酒。多吃富含维生素、蛋白质的食物有助于疾病的康复，如新鲜的蔬菜、水果及牛奶、鸡蛋等。
有一些食疗方有助于生殖器疱疹的康复
1.薏仁粥(《本草纲目》)
取薏苡仁60克。加水适量，煮粥，加入白糖适量食用，每日1次。
用于阴部疱疹缓解期，具有健脾利湿、清热解毒之效，长期应用可减少复发。
2.苦瓜饮(《福建中草药》)
用鲜苦瓜适量。绞汁1杯，开水冲服。
本饮具有清热解毒利湿之功，可用于阴部疱疹中医辨证属于毒热夹湿者。
6）对生殖器疱疹的护理首先要预防它的感染，特别是夏天，气温高，出汗多，加上局部的搔抓，很容易出现局部的感染，每天用清水清洗生殖器部位是必要的。当出现局部的感染后，要及时用消毒水清洗局部。常用3％硼酸水200毫升外洗患部，也可用黄连素1片研末加入200毫升沸开水中，待凉后清洗患部。
其次，避免局部的搔抓，不可用刺激性太强的药品。患病后需注意预防感冒、着凉、劳累，以减少复发。治疗期间禁房事。
7）预防生殖器疱疹
1.避免与发作期生殖器疱疹病人性接触，避孕套不能完全防止病毒的传播。
2.早期妊娠妇女患生殖器疱疹最好中止妊娠，晚期妊娠感染HSV者宜做剖腹产。
3.保持局部卫生清洁。
